Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms