Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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