Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GCSAMQ8N6F7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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