Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms