Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms