Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SFT2D3Q587I9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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