Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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GRIK4Q16099 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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GRIK4Q16099 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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