Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms