Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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