Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CAMK2BQ13554 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 CCNG2-205ENST00000509972 1549 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms