Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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