Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
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BPTFQ12830 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BPTFQ12830 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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