Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms