Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIRAP54198 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms