Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RECQLP46063 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms