Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CTSSP25774 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CTSSP25774 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CTSSP25774 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CTSSP25774 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CTSSP25774 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CTSSP25774 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTSSP25774 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CTSSP25774 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CTSSP25774 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CTSSP25774 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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