Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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