Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GLI1P08151 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GLI1P08151 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GLI1P08151 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GLI1P08151 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GLI1P08151 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GLI1P08151 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GLI1P08151 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GLI1P08151 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GLI1P08151 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GLI1P08151 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GLI1P08151 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI1P08151 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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