Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN11O75508 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN11O75508 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN11O75508 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN11O75508 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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