Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAG9O60271 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms