Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC137794.1-201ENST00000509185 914 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms