Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms