Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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