Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms