Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms