Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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