Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC020912.1-201ENST00000638312 5059 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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