Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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