Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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