Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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NCF4Q15080 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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