Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PEX6Q13608 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PEX6Q13608 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PEX6Q13608 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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