Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNTB2Q13425 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms