Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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BNIP1Q12981 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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BNIP1Q12981 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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