Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms