Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms