Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CYP39A1-205ENST00000619708 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FCRLA-203ENST00000309691 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL009172.1-201ENST00000436365 1098 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC01304-203ENST00000453880 812 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms