Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NESP48681 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NESP48681 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NESP48681 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NESP48681 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms