Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL9P32969 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL9P32969 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms