Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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PTPRAP18433 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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