Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-EP13747 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-EP13747 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-EP13747 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-EP13747 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-EP13747 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-EP13747 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-EP13747 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms