Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms