Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SFTPBP07988 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SFTPBP07988 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SFTPBP07988 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SFTPBP07988 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SFTPBP07988 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SFTPBP07988 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SFTPBP07988 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SFTPBP07988 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SFTPBP07988 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPBP07988 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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