Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HCN3Q9P1Z3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms