Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms