Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms