Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CICQ96RK0 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms