Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRIM48Q8IWZ4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRIM48Q8IWZ4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRIM48Q8IWZ4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TRIM48Q8IWZ4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TRIM48Q8IWZ4 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TRIM48Q8IWZ4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM48Q8IWZ4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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