Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TTLL9Q3SXZ7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TTLL9Q3SXZ7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TTLL9Q3SXZ7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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