Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms