Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRIM16LQ309B1 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms